A Assessoria de Infraestrutura responde pela manutenção, revitalização e construção de unidades de saúde; coordena as ações de manutenção e atualização tecnológica, de equipamentos e serviços, garantindo que a estrutura física esteja em excelentes condições para o bom desempenho de todas as áreas da Secretaria Municipal de Saúde.

Estão vinculados à Assessoria de Infraestrutura os Departamentos de Obras e Manutenção Predial, Patrimônio e Fiscalização de Contratos, e Tecnologia e Modernização.